MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5II

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010123	AGCCC	2	10	46	55	20 %	0 %	20 %	60 %	161986652
2	NC_010123	GTC	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986652
3	NC_010123	CTC	2	6	135	140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986652
4	NC_010123	CCG	2	6	240	245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
5	NC_010123	GAT	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
6	NC_010123	CCGC	2	8	280	287	0 %	0 %	25 %	75 %	161986652
7	NC_010123	CCG	2	6	385	390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
8	NC_010123	CGC	2	6	465	470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
9	NC_010123	ACCG	2	8	485	492	25 %	0 %	25 %	50 %	161986652
10	NC_010123	GTGC	2	8	533	540	0 %	25 %	50 %	25 %	161986652
11	NC_010123	TCA	3	9	585	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986652
12	NC_010123	CCGA	2	8	611	618	25 %	0 %	25 %	50 %	161986652
13	NC_010123	GTA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
14	NC_010123	GAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
15	NC_010123	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986652
16	NC_010123	TGA	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
17	NC_010123	CGCT	2	8	723	730	0 %	25 %	25 %	50 %	161986652
18	NC_010123	GAC	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
19	NC_010123	GATG	2	8	970	977	25 %	25 %	50 %	0 %	161986652
20	NC_010123	GC	3	6	1029	1034	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
21	NC_010123	CG	3	6	1056	1061	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
22	NC_010123	TCC	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986652
23	NC_010123	ATG	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
24	NC_010123	GTC	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986652
25	NC_010123	GC	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
26	NC_010123	ACG	2	6	1419	1424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
27	NC_010123	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
28	NC_010123	CAG	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
29	NC_010123	CAGCC	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	161986652
30	NC_010123	GC	3	6	1536	1541	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
31	NC_010123	CCA	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986652
32	NC_010123	GC	3	6	1595	1600	0 %	0 %	50 %	50 %	161986652
33	NC_010123	CCG	2	6	2302	2307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
34	NC_010123	GCAT	2	8	2335	2342	25 %	25 %	25 %	25 %	161986653
35	NC_010123	GC	3	6	2358	2363	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
36	NC_010123	CCG	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
37	NC_010123	CAG	2	6	2451	2456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
38	NC_010123	CGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
39	NC_010123	CCG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
40	NC_010123	CGC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
41	NC_010123	CG	3	6	2585	2590	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
42	NC_010123	TCG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
43	NC_010123	TCA	2	6	2624	2629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986653
44	NC_010123	CCG	2	6	2673	2678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
45	NC_010123	CGA	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
46	NC_010123	CAC	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986653
47	NC_010123	TTC	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986653
48	NC_010123	GCA	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
49	NC_010123	CGG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986653
50	NC_010123	GC	3	6	2829	2834	0 %	0 %	50 %	50 %	161986653
51	NC_010123	TGC	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
52	NC_010123	GCTT	2	8	2955	2962	0 %	50 %	25 %	25 %	161986653
53	NC_010123	TTG	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986653
54	NC_010123	CGC	2	6	3060	3065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
55	NC_010123	CCG	2	6	3092	3097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
56	NC_010123	CGT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
57	NC_010123	CCA	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986653
58	NC_010123	CA	3	6	3261	3266	50 %	0 %	0 %	50 %	161986653
59	NC_010123	CCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
60	NC_010123	TCG	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
61	NC_010123	GC	3	6	3512	3517	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
62	NC_010123	GT	3	6	3611	3616	0 %	50 %	50 %	0 %	161986654
63	NC_010123	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986654
64	NC_010123	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986654
65	NC_010123	AGCC	2	8	3734	3741	25 %	0 %	25 %	50 %	161986654
66	NC_010123	GC	3	6	3742	3747	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
67	NC_010123	CGACG	2	10	3752	3761	20 %	0 %	40 %	40 %	161986654
68	NC_010123	GGCA	2	8	3776	3783	25 %	0 %	50 %	25 %	161986654
69	NC_010123	GCGG	2	8	3784	3791	0 %	0 %	75 %	25 %	161986654
70	NC_010123	GC	3	6	3815	3820	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
71	NC_010123	TGT	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986654
72	NC_010123	TCG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986654
73	NC_010123	CG	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
74	NC_010123	CGCC	2	8	3997	4004	0 %	0 %	25 %	75 %	161986654
75	NC_010123	GAC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
76	NC_010123	GCA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
77	NC_010123	CGG	2	6	4048	4053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986654
78	NC_010123	GC	3	6	4075	4080	0 %	0 %	50 %	50 %	161986654
79	NC_010123	ACG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
80	NC_010123	AGC	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
81	NC_010123	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986654
82	NC_010123	TGGT	2	8	4547	4554	0 %	50 %	50 %	0 %	161986655
83	NC_010123	GA	3	6	4558	4563	50 %	0 %	50 %	0 %	161986655
84	NC_010123	GC	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	161986655
85	NC_010123	CGAC	2	8	4614	4621	25 %	0 %	25 %	50 %	161986655
86	NC_010123	GAT	2	6	4734	4739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986655
87	NC_010123	AGC	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986655
88	NC_010123	CG	3	6	4866	4871	0 %	0 %	50 %	50 %	161986655
89	NC_010123	GGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986655
90	NC_010123	GGAT	2	8	5003	5010	25 %	25 %	50 %	0 %	161986655
91	NC_010123	CAC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986655
92	NC_010123	GGT	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986655
93	NC_010123	CAT	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986656
94	NC_010123	GC	3	6	5127	5132	0 %	0 %	50 %	50 %	161986656
95	NC_010123	GCC	2	6	5165	5170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986656
96	NC_010123	GCA	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986656
97	NC_010123	CAC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986656
98	NC_010123	ACC	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986656
99	NC_010123	CGG	2	6	5409	5414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986656
100	NC_010123	CGA	3	9	5431	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986656
101	NC_010123	CAG	2	6	5606	5611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986657
102	NC_010123	GC	3	6	5613	5618	0 %	0 %	50 %	50 %	161986657
103	NC_010123	CGC	2	6	5651	5656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986657
104	NC_010123	CG	4	8	5667	5674	0 %	0 %	50 %	50 %	161986657
105	NC_010123	TGG	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986657
106	NC_010123	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986657
107	NC_010123	CG	3	6	5841	5846	0 %	0 %	50 %	50 %	161986658
108	NC_010123	GCG	2	6	5855	5860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986658
109	NC_010123	GCGA	2	8	5900	5907	25 %	0 %	50 %	25 %	161986658
110	NC_010123	GC	3	6	5970	5975	0 %	0 %	50 %	50 %	161986658
111	NC_010123	AGG	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986658
112	NC_010123	C	6	6	6006	6011	0 %	0 %	0 %	100 %	161986659
113	NC_010123	GCG	2	6	6028	6033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
114	NC_010123	GGC	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
115	NC_010123	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
116	NC_010123	GC	3	6	6087	6092	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
117	NC_010123	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
118	NC_010123	CCA	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986659
119	NC_010123	GC	3	6	6189	6194	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
120	NC_010123	CAG	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
121	NC_010123	GC	3	6	6243	6248	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
122	NC_010123	GCA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
123	NC_010123	GCC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
124	NC_010123	GCA	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
125	NC_010123	GCC	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
126	NC_010123	GAC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
127	NC_010123	GTG	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986659
128	NC_010123	GT	3	6	6428	6433	0 %	50 %	50 %	0 %	161986659
129	NC_010123	CG	3	6	6434	6439	0 %	0 %	50 %	50 %	161986659
130	NC_010123	CGC	2	6	6541	6546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
131	NC_010123	CGT	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986659
132	NC_010123	CGC	2	6	6599	6604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
133	NC_010123	CGG	2	6	6661	6666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
134	NC_010123	GGAT	2	8	6824	6831	25 %	25 %	50 %	0 %	161986660
135	NC_010123	CATTGC	2	12	6889	6900	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161986660
136	NC_010123	GCG	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
137	NC_010123	GCC	2	6	7091	7096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986660
138	NC_010123	CG	3	6	7206	7211	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
139	NC_010123	GTG	2	6	7290	7295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986660
140	NC_010123	CGC	2	6	7313	7318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986660
141	NC_010123	CG	3	6	7338	7343	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
142	NC_010123	CG	3	6	7375	7380	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
143	NC_010123	CCA	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986660
144	NC_010123	CAA	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986660
145	NC_010123	GGC	2	6	7442	7447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
146	NC_010123	GCCAT	2	10	7479	7488	20 %	20 %	20 %	40 %	161986660
147	NC_010123	ATCG	2	8	7535	7542	25 %	25 %	25 %	25 %	161986660
148	NC_010123	GAA	2	6	7571	7576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986660
149	NC_010123	GAG	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986660
150	NC_010123	GC	3	6	7661	7666	0 %	0 %	50 %	50 %	161986660
151	NC_010123	GCG	2	6	7675	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
152	NC_010123	CGA	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986661
153	NC_010123	CGG	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
154	NC_010123	CG	3	6	7739	7744	0 %	0 %	50 %	50 %	161986661
155	NC_010123	GCG	3	9	7742	7750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
156	NC_010123	CGG	2	6	7761	7766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
157	NC_010123	GCC	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986661
158	NC_010123	CGA	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986661
159	NC_010123	GCG	2	6	7947	7952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
160	NC_010123	TTA	2	6	8191	8196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986662
161	NC_010123	GGATGC	2	12	8203	8214	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	161986662
162	NC_010123	GAT	2	6	8260	8265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986662
163	NC_010123	CAA	2	6	8296	8301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986662
164	NC_010123	GGC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986662
165	NC_010123	AG	3	6	8339	8344	50 %	0 %	50 %	0 %	161986662
166	NC_010123	GCC	2	6	8365	8370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986662
167	NC_010123	GCC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986662
168	NC_010123	GCG	2	6	8508	8513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986662
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171	NC_010123	ATCC	2	8	8786	8793	25 %	25 %	0 %	50 %	161986662
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175	NC_010123	AG	3	6	9139	9144	50 %	0 %	50 %	0 %	161986662
176	NC_010123	CG	3	6	9166	9171	0 %	0 %	50 %	50 %	161986662
177	NC_010123	CAG	2	6	9325	9330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986662
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181	NC_010123	CTGT	2	8	9527	9534	0 %	50 %	25 %	25 %	161986662
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220	NC_010123	CGG	2	6	12343	12348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986667
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232	NC_010123	GACAG	2	10	12961	12970	40 %	0 %	40 %	20 %	161986668
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234	NC_010123	GC	3	6	13071	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	161986668
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243	NC_010123	GACCTG	2	12	13597	13608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	161986669
244	NC_010123	ACGTC	2	10	13636	13645	20 %	20 %	20 %	40 %	161986669
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246	NC_010123	GGC	2	6	13742	13747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986669
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251	NC_010123	CT	3	6	14224	14229	0 %	50 %	0 %	50 %	161986670
252	NC_010123	CG	4	8	14230	14237	0 %	0 %	50 %	50 %	161986670
253	NC_010123	CCG	2	6	14285	14290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986670
254	NC_010123	TC	3	6	14346	14351	0 %	50 %	0 %	50 %	161986670
255	NC_010123	TGGC	2	8	14398	14405	0 %	25 %	50 %	25 %	161986670
256	NC_010123	G	6	6	14467	14472	0 %	0 %	100 %	0 %	161986670
257	NC_010123	CG	3	6	14500	14505	0 %	0 %	50 %	50 %	161986670
258	NC_010123	AGC	2	6	14734	14739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986671
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262	NC_010123	ACG	2	6	14959	14964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986671
263	NC_010123	GGC	2	6	14977	14982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986671
264	NC_010123	CGG	2	6	15007	15012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986671
265	NC_010123	GCC	2	6	15086	15091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986671
266	NC_010123	GCG	2	6	15156	15161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986671
267	NC_010123	CTG	2	6	15234	15239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986671
268	NC_010123	AGC	2	6	15325	15330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986671
269	NC_010123	GCG	2	6	15413	15418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986671
270	NC_010123	GAA	2	6	15502	15507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986671
271	NC_010123	GCG	2	6	15515	15520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986671
272	NC_010123	TCG	2	6	15529	15534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986671
273	NC_010123	ATG	2	6	15547	15552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986671
274	NC_010123	GAA	3	9	15819	15827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986672
275	NC_010123	CTG	2	6	15858	15863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986672
276	NC_010123	TGA	2	6	15869	15874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986672
277	NC_010123	CGA	2	6	15895	15900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986672
278	NC_010123	GTT	2	6	15931	15936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986672
279	NC_010123	GCC	2	6	15955	15960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986672
280	NC_010123	TCT	2	6	16070	16075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986672
281	NC_010123	CCGG	2	8	16230	16237	0 %	0 %	50 %	50 %	161986672
282	NC_010123	ATGG	2	8	16240	16247	25 %	25 %	50 %	0 %	161986672
283	NC_010123	GCGG	2	8	16271	16278	0 %	0 %	75 %	25 %	161986672
284	NC_010123	CTA	2	6	16427	16432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986672
285	NC_010123	CAG	2	6	16542	16547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.